В 1993, после закрытия чемпионата спорт-прототипов, Петер Заубер создал свою команду в чемпионате Формула-1. Заубер продолжил сотрудничество с концерном «Мерседес», получая от него двигатели. Несмотря на успешный дебют Хайнца-Харальда Френтцена и статус официального представителя «Мерседес», 1994 год стал неудачным для конюшни Петера Заубера. Ведлингер получил тяжёлую травму на Гран-при Монако 1994 года и выбыл из строя до конца сезона. Руководитель команды снял с гонки и своего второго пилота до выяснения обстоятельств. Мерседес, разочарованный результатами «Заубера», отказал им в поддержке и заключил соглашение с «МакЛарен». Новым титульным спонсором швейцарской конюшни стала компания Red Bull. Следующие два года команда провела, используя двигатели «Форд», менее мощные и надёжные, чем их предшественники. Однако это не помешало Френтцену принести своей команде бронзу на Гран-при Италии 1995 года. На следующий год его успех повторил Джонни Херберт, поднявшийся на подиум в Монако. Команда из года в год стабильно занимала седьмое место в кубке конструкторов. С 1997 года «Заубер» заключил выгодное соглашение с командой «Феррари» о поставках двигателей. «Зубры» отныне получали прошлогоднюю модификацию двигателей «Скудерии», каждый год новую. Заубер не прогадал: обновление состава привело к резкому скачку результатов. Чемпион Формулы-3000 Ник Хайдфельд и дебютант Кими Райкконен подарили Петеру Зауберу лучший на тот момент сезон в истории его команды. Кими завоевал очко в дебютной гонке, а Ник смог подняться на подиум на Гран-при Бразилии 2001 года. По итогам года на счету «Заубера» было 21 очко и четвертое место в Кубке Конструкторов. Под впечатлением от этого сезона, Рон Деннис пригласил Райкконена вторым пилотом в «МакЛарен», на место уходящего из Формулы-1 чемпиона мира Мики Хаккинена. Х.-Х. Френтцен принес команде ее последний в истории подиум. С 2004 года, по договорённости с Феррари, Масса вновь вернулся за руль швейцарских болидов. 2005 год ознаменовался громким разрывом союза «Уильямс» и BMW, объявивших о расторжении договоренностей на последующие чемпионаты и разделе успешно выступавшей команды «Willliams BMW». БМВ обратилось к Петеру Зауберу с предложением о продаже контрольного пакета акций его компании. Швейцарец ответил согласием, и с конца 2005 года «Заубер» стал подразделением BMW и официальной заводской командой БМВ в Формуле-1, формально называющейся «BMW Sauber». 2010 год. В середине сезона 2009 концерн BMW заявил об уходе из Формулы-1. После долгих и трудных переговоров, 28 ноября 2009 года Петер Заубер выкупил долю акций BMW и вновь возглавил команду. Началась подготовка новой машины для сезона 2010 - Sauber C29. Кандидатами на 3 места в команде являлись опытные Ник Хайдфельд, Ярно Трулли, Педро де ла Роса, а также два молодых перспективных пилота – японец Камуи Кобаяши и россиянин Виталий Петров. 17 декабря 2009 года было объявлено о контракте с Камуи Кобаяши. 19 января 2010 подвержден контракт с Педро де ла Росой.
